急诊与重症医学科是卫生部临床重点专科，上海市小儿急救中心。可满足各类外科监护、重大创伤急救、多脏器功能衰竭救治和脏器移植监护。 拥有华东六省一市院际危重儿童转运系统（转运手机：18017591034），转运范围覆盖上海为中心1000km内大型城市。
急诊按国际标准建设急诊抢救室，体现了先进、全面、系统、规范的急救系统。国内率先实行国际规范的CTAS标准五级分诊制度，拥有系统的儿童意外伤害（含创伤急救）救治系统。重症医学科（ICU）为30万级层流病房，配有多器官功能不全支持系统（CRRT、ALSS、ECMO等）等各类监护与治疗设备，建立儿童重症感染-儿童器官功能支持（ECOS）为发展重点的高地高峰，对影响死亡率的五大重要危重症ARDS、脓毒症、休克、多器官功能不全、严重创伤制定规范化诊疗；开展儿童高级呼吸支持技术（高频通气+NO吸入+表面活性物质）、颅内压/脑温监测、连续血液净化技术、体外膜肺技术、人工肝技术和支气管肺泡灌洗、重症感染AMS模式等先进技术，完全满足卫生部重症医学科建设和管理标准。
建立了“院际危重病转运-急诊室-重症医学科的医疗体系，医疗-培训（模拟教学）-研究”为架构的儿童急重症救治体系已经基本建立，包括硬件建设、人才建设、制度建设、科研建设四个方面的基础建设，为医院疑难病、重大疾病诊治提供了高质量的服务平台。中心具备覆盖华东六省一市的1200公里院际危重病转运体系，保障了转运的高效实施，实施了严重创伤、机械通气病例的长途安全转运
建立有复旦大学儿科医院-美国心脏病协会（AHA）儿童高级心血管急救培训中心，该中心是国内儿童医院中设施最齐备、最先进，符合国际模式的儿童高级培训中心，主要从事基础生命支持（BLS）、儿童高级生命支持（PALS）、高仿真模拟教学（Simulation）的系统培训，分别具备AHA授权的BLS和PALS 的Provider和Instructor证书，中心获得授权进行上述两证的颁发，面向全国培训和合作进行分中心建设和培训。2012年起开展儿童急重症模拟教学，已经建立了20余项目模拟教学课程，包括气管插管、骨髓输液、除颤、氧疗，惊厥、呼吸困难，严重脓毒症、ARDS、儿童多发伤，纤支镜、连续血液净化和ECMO技术模拟教学项目；与瑞典卡洛琳斯卡大学ECMO中心合作建立儿童ECMO模拟教学培训基地。
专业先后获得了十四五国家重点研发计划项目、十二五科技部重大专项、国家自然科学基金、CMB基金，上海市科委科研基金重点项目、复旦大学985及211项目建设项目、上海市卫生局重点学科等课题以及中加高级急救培训项目等多项国际合作科研、培训项目，并多次获得卫生部和上海市科技进步奖。近5年科研经费累计超过3000万。
单位儿童危重症国内外重要机构任职，包括复旦大学附属儿科医院重症医学科为世界儿童危重病协会(WFPICCS)理事单位、儿童脓毒症联合实验室成员WFPICC Pediatric Sepsis CoLaboratory Steering Committee成员单位、中华医学会儿科分会急救学组副组长单位、中国医师协会体外生命支持专委会儿科ECMO学组组长单位、中国重症血液净化协作组儿科副组长单位、国家卫健委脑死亡判定专家组成员单位、上海市儿科学会急救学组组长单位、上海市社会医疗机构协会急诊危重症专委会副主任委员单位、中国医院协会模拟医学专委会常委单位。
重视人性化管理。重视病人就医体验，提高家属与医护人员交流，减轻家属忧虑。